म्यूजिकल गार्डन का उद्घाटन फरवरी 2006 में तत्कालीन राष्ट्रपति ए.पी.जे. अब्दुल कलाम की पहल पर किया गया था। संगीत और विज्ञान को मिलाकर बनाया गया मानव रचनात्मकता का यह एक उदाहरण है। इसे राष्ट्रपति संपदा में एक ऐसे क्षेत्र में स्थापित किया गया है जिसे पहले नर्सरी के रूप में इस्तेमाल किया जाता था। इस म्यूजिकल गार्डन में पानी के तीन बड़े फव्वारे हैं जो डिजिटल इलेक्ट्रॉनिक्स, इलेक्ट्रोमैग्नेटिज्म, हाइड्रो डायनेमिक्स और हाइड्रोस्टैटिक्स को दर्शाते हैं। डिजिटाइज्ड संगीत बजाया जाता है और ऑडियो सिस्टम को कम्प्यूटरीकृत प्रोग्राम के माध्यम से चलाया जाता है

चारों ओर से टेनिस कोर्ट, जैव-विविधता पार्क, बोनसाई गार्डन और हर्बल गार्डन से घिरा हुआ यह म्यूजिकल गार्डन इस क्षेत्र की शांति को पीछे छोड़ते हुए, वातावरण को जीवंतता प्रदान करता है। इस उद्यान के परिसर में अक्सर राष्ट्रीय पक्षी मोर को आनंद से घूमते हुए देखा जा सकता है। संगीतमय फव्वारों में एक तालमेल से शहनाई, वीणा की शास्त्रीय धुनें और वंदे मातरम जैसे देशभक्ति गीत बजते रहते हैं। सफेद से लेकर लाल रंग तक कई रंगों की जगमगाती रोशनी से एक जादुई अनुभव होता है।